Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39BQ5VTQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC39BQ5VTQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms