Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOGA3Q5TF21 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOGA3Q5TF21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA3Q5TF21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms