Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ERCC6L2Q5T890 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ERCC6L2Q5T890 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERCC6L2Q5T890 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms