Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PERM1Q5SV97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PERM1Q5SV97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms