Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRB2Q5IJ48 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRB2Q5IJ48 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms