Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMPK2Q5EBM0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms