Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms