Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM259Q4ZIN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms