Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC1Q4ZHG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms