Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9C1Q4G0N8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9C1Q4G0N8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9C1Q4G0N8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms