Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms