Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX7Q2KHR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX7Q2KHR2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms