Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF239Q16600 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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