Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PCSK7Q16549 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK7Q16549 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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