Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms