Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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