Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A5Q15758 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A5Q15758 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 591.5 ms