Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALX1Q15699 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALX1Q15699 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
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