Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms