Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCM1Q15154 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms