Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKD1Q15139 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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