Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD3Q15054 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLD3Q15054 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD3Q15054 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLD3Q15054 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms