Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX17Q15036 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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