Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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