Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNIQ14094 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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