Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP5Q14008 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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