Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms