Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NAE1Q13564 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAE1Q13564 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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