| NAE1 | Q13564 | SRXN1-201 | ENST00000381962 | 2698 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.94 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ANOS2P-203 | ENST00000472227 | 1816 nt | BASIC | 21.94 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CD72-202 | ENST00000378430 | 585 nt | TSL 3 BASIC | 21.94 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZEB1-AS1-205 | ENST00000605946 | 382 nt | TSL 5 BASIC | 21.94 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | EXOG-217 | ENST00000630638 | 197 nt | TSL 5 BASIC | 21.94 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | MT2A-201 | ENST00000245185 | 786 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SETD9-201 | ENST00000285947 | 1619 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRIM7-202 | ENST00000334421 | 1228 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | PXK-202 | ENST00000356151 | 2037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPG21-202 | ENST00000416889 | 1533 nt | TSL 2 BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CHAC1-201 | ENST00000444189 | 1204 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF302-211 | ENST00000509528 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP001267.3-203 | ENST00000554407 | 579 nt | TSL 2 BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | IRF3-228 | ENST00000601291 | 1556 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPP38-207 | ENST00000616640 | 1537 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | TTC34-202 | ENST00000637179 | 1775 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 21.93 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ARRDC2-202 | ENST00000379656 | 2528 nt | TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | PEX5-205 | ENST00000420616 | 2477 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AMZ2-202 | ENST00000359904 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | TSEN15-201 | ENST00000361641 | 1960 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | H19-210 | ENST00000439725 | 1929 nt | TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | METTL9-202 | ENST00000396014 | 1817 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | IRF3-201 | ENST00000309877 | 1691 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | C1QTNF1-207 | ENST00000580454 | 1396 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | UROS-204 | ENST00000368797 | 1313 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | LSM4-201 | ENST00000252816 | 986 nt | TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | PEMT-202 | ENST00000395781 | 1050 nt | TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CUL4A-209 | ENST00000488558 | 1111 nt | TSL 3 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CHTF8-205 | ENST00000519520 | 856 nt | TSL 2 BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | MFSD7-201 | ENST00000322224 | 2123 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | WRNIP1-205 | ENST00000618555 | 2651 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNF19B-203 | ENST00000373456 | 2560 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 21.92 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | FNDC4-201 | ENST00000264703 | 1657 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC064853.3-201 | ENST00000641801 | 1658 nt | APPRIS P1 BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC106-205 | ENST00000588740 | 1404 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RARA-203 | ENST00000394086 | 2008 nt | TSL 2 BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ARF1-213 | ENST00000540651 | 1972 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | GRIN2D-201 | ENST00000263269 | 5093 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | LDB1-201 | ENST00000361198 | 2285 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | HOXA10-206 | ENST00000613671 | 2175 nt | TSL 5 BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | MAP6D1-201 | ENST00000318631 | 2111 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 21.91 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | IQCJ-SCHIP1-202 | ENST00000460298 | 1884 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | C14orf80-211 | ENST00000450383 | 1107 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | IRX5-201 | ENST00000320990 | 2061 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CBWD3-213 | ENST00000618217 | 1611 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | KCNIP2-206 | ENST00000356640 | 1989 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | CPNE2-202 | ENST00000535318 | 2316 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AARD-201 | ENST00000378279 | 2299 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | MRPL38-201 | ENST00000309352 | 1888 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SRPK3-204 | ENST00000370108 | 1863 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | DUSP8P5-201 | ENST00000422884 | 1815 nt | BASIC | 21.9 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF503-AS2-202 | ENST00000466942 | 1430 nt | TSL 2 BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | PCYT2-201 | ENST00000331285 | 2147 nt | TSL 2 BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | DONSON-204 | ENST00000432378 | 1618 nt | TSL 5 BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC151-203 | ENST00000591179 | 1943 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | ADAMTS13-203 | ENST00000371910 | 1074 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | TFPT-201 | ENST00000391757 | 774 nt | TSL 5 BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | TFPT-202 | ENST00000391758 | 804 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | KRT16P3-201 | ENST00000439127 | 1283 nt | BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC073111.5-204 | ENST00000498682 | 1167 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | C21orf2-202 | ENST00000339818 | 2233 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | KCNS1-202 | ENST00000537075 | 2136 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | ADGRA2-202 | ENST00000412232 | 5651 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.89 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | OSCAR-203 | ENST00000356532 | 1355 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | OSCAR-204 | ENST00000358375 | 1389 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | OSCAR-210 | ENST00000616447 | 1358 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | NMI-201 | ENST00000243346 | 1623 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTMR14-202 | ENST00000351233 | 2105 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | TARSL2-207 | ENST00000615656 | 2356 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | IQCJ-SCHIP1-201 | ENST00000412423 | 2067 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MMP28-203 | ENST00000612672 | 1092 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MEIOB-202 | ENST00000397344 | 1792 nt | TSL 5 BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | THRA-201 | ENST00000264637 | 2538 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | HNRNPD-202 | ENST00000352301 | 1667 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | SAMD8-202 | ENST00000372690 | 1654 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | DLL3-201 | ENST00000205143 | 2332 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.88 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC22A17-201 | ENST00000206544 | 2284 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | GDI1-204 | ENST00000447750 | 2474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | HNRNPAB-208 | ENST00000515193 | 1595 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | DISC1-220 | ENST00000602873 | 1553 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF213-208 | ENST00000576416 | 2240 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | C7orf26-202 | ENST00000359073 | 1762 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | CDC16-206 | ENST00000375310 | 2156 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | ABHD17C-201 | ENST00000258884 | 2368 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | NPEPL1-201 | ENST00000356091 | 2378 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | IRF2BP1-201 | ENST00000302165 | 2564 nt | APPRIS P1 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIF-201 | ENST00000215754 | 939 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM151B-201 | ENST00000438774 | 1140 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL117209.1-201 | ENST00000560931 | 828 nt | TSL 3 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | CFD-202 | ENST00000592860 | 809 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6724-1-201 | ENST00000616420 | 92 nt | BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6724-2-201 | ENST00000616483 | 92 nt | BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6724-4-201 | ENST00000617390 | 92 nt | BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6724-3-201 | ENST00000622482 | 92 nt | BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | TUBBP5-204 | ENST00000635438 | 565 nt | TSL 4 BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | DNAAF3-203 | ENST00000524407 | 2059 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | UBL7-202 | ENST00000395081 | 1427 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | BIN1-205 | ENST00000351659 | 2365 nt | TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | POU2F3-206 | ENST00000543440 | 1953 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |
| NAE1 | Q13564 | NFE2L3P1-201 | ENST00000588207 | 1959 nt | BASIC | 21.87 | ■■□□□ 1.09 | | |