Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAMK2BQ13554 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAMK2BQ13554 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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