Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC1Q13547 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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