Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB3Q13509 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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