Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GRIN2BQ13224 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GRIN2BQ13224 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2BQ13224 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
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