Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF1Q13077 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF1Q13077 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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