Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFX1Q12986 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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