Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN1Q12860 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN1Q12860 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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