Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TWF1Q12792 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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