Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 LDB17YDL146W 1476 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 CLB4YLR210W 1383 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 SMP1YBR182C 1359 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 JAC1YGL018C 555 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 NPY1YGL067W 1155 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 LSO1YJR005C-A 282 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 snR3snR3 194 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 SWC3YAL011W 1878 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 NUP116YMR047C 3342 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 CAB3YKL088W 1716 nt4.32□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 HOT1YMR172W 2160 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 PRD1YCL057W 2139 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 IBA57YJR122W 1494 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 MMR1YLR190W 1476 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 PRM1YNL279W 1986 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 RAM1YDL090C 1296 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 TFB3YDR460W 966 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 GPP1YIL053W 753 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 COA3YJL062W-A 258 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 PML1YLR016C 615 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 PNP1YLR209C 936 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 FBP1YLR377C 1047 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 HUL4YJR036C 2679 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 MSC2YDR205W 2175 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 ALG6YOR002W 1635 nt4.31□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 TGL4YKR089C 2733 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 GAD1YMR250W 1758 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 GON7YJL184W 372 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 TVP38YKR088C 1014 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 CPR6YLR216C 1116 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 YNL134CYNL134C 1131 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 CDC21YOR074C 915 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 IMA3YIL172C 1770 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 IMA4YJL221C 1770 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 ATM1YMR301C 2073 nt4.3□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 MAG2YLR427W 2013 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 IMD2YHR216W 1572 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 COQ4YDR204W 1008 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 NAT2YGR147C 867 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 MNN11YJL183W 1269 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 SPO19YPL130W 672 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 snR19snR19 568 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 NUP2YLR335W 2163 nt4.29□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 DIT1YDR403W 1611 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 GSM1YJL103C 1857 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 CDS1YBR029C 1374 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 TRE1YPL176C 2352 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 IXR1YKL032C 1794 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 MAD2YJL030W 591 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 YLR125WYLR125W 411 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 YML119WYML119W 1074 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 THI20YOL055C 1656 nt4.28□□□□□ -1.72
SNF8Q12483 STB2YMR053C 2553 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 TDA11YHR159W 1515 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 GSH2YOL049W 1476 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 CPR4YCR069W 957 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 UBC6YER100W 753 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 COS6YGR295C 1146 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 YJL215CYJL215C 360 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 RPC19YNL113W 429 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 MGR2YPL098C 342 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 ECM32YER176W 3366 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 NNK1YKL171W 2787 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 SBE2YDR351W 2595 nt4.27□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 NOP58YOR310C 1536 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 FMP48YGR052W 1110 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 YMR082CYMR082C 357 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 PDX3YBR035C 687 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 MET4YNL103W 2019 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 MDM34YGL219C 1380 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 ARG4YHR018C 1392 nt4.26□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 PER1YCR044C 1074 nt4.25□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 OMS1YDR316W 1416 nt4.25□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.25□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.25□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 TIP20YGL145W 2106 nt4.25□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 MDR1YGR100W 2853 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 ISR1YPR106W 1332 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 SKM1YOL113W 1968 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 YCR006CYCR006C 474 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 snR7-SsnR7-S 179 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 HSP31YDR533C 714 nt4.24□□□□□ -1.73
SNF8Q12483 RNA15YGL044C 891 nt4.24□□□□□ -1.73
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