Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YND1YER005W 1893 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 BCP1YDR361C 852 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 YIL171WYIL171W 330 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 YLR407WYLR407W 687 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 YIF1YNL263C 945 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 ARG8YOL140W 1272 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 VID28YIL017C 2766 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 GAS3YMR215W 1575 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 NOP58YOR310C 1536 nt3.8□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 JHD2YJR119C 2187 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 YMD8YML038C 1329 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 RPS16BYDL083C 432 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 RPL24AYGL031C 468 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 LAS1YKR063C 1509 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 RRN11YML043C 1524 nt3.79□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 MNN4YKL201C 3537 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 NHX1YDR456W 1902 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 SRG1SRG1 551 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 HSP31YDR533C 714 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 YTH1YPR107C 627 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 PTA1YAL043C 2358 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 BRE4YDL231C 3378 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 HOF1YMR032W 2010 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 KCH1YJR054W 1494 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 DBF2YGR092W 1719 nt3.78□□□□□ -1.8
ATG41Q12048 GIP2YER054C 1647 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SRV2YNL138W 1581 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YDL094CYDL094C 510 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 HSP42YDR171W 1128 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 IPK1YDR315C 846 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 IRC7YFR055W 1023 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 FMP33YJL161W 543 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ISY1YJR050W 708 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 RPL14AYKL006W 417 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 NKP2YLR315W 462 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 PCL1YNL289W 840 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 CDC48YDL126C 2508 nt3.77□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ATH1YPR026W 3636 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 VHS2YIL135C 1311 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 GPI18YBR004C 1302 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ELA1YNL230C 1140 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 MDM12YOL009C 816 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SRO7YPR032W 3102 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ARG4YHR018C 1392 nt3.76□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 MET12YPL023C 1974 nt3.75□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YMR315WYMR315W 1050 nt3.75□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YNL165WYNL165W 1221 nt3.75□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 MPP10YJR002W 1782 nt3.75□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YLH47YPR125W 1365 nt3.75□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 FLO8YER109C 2400 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SRP72YPL210C 1923 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 CAB4YGR277C 918 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 CIA2YHR122W 696 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 DBR1YKL149C 1218 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SEC13YLR208W 894 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SIW14YNL032W 846 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YGP1YNL160W 1065 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 STP22YCL008C 1158 nt3.74□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ECM22YLR228C 2445 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 URA7YBL039C 1740 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 PRM1YNL279W 1986 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SSB1YDL229W 1842 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ATG2YNL242W 4779 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 RPS11AYDR025W 471 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SSO1YPL232W 873 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ATM1YMR301C 2073 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 SLD2YKL108W 1362 nt3.73□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 FAS2YPL231W 5664 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 VID30YGL227W 2877 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 FSH3YOR280C 801 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 EFM2YBR271W 1260 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 ARN1YHL040C 1884 nt3.72□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 CDC14YFR028C 1656 nt3.71□□□□□ -1.81
ATG41Q12048 MMT1YMR177W 1533 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ADP1YCR011C 3150 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 YLR346CYLR346C 306 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ECM23YPL021W 564 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 PRP9YDL030W 1593 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RTC1YOL138C 4026 nt3.71□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 APE1YKL103C 1545 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 NCR1YPL006W 3513 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 NBP2YDR162C 711 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 SHE1YBL031W 1017 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 YBL059WYBL059W 582 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RPS19AYOL121C 435 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 HEM15YOR176W 1182 nt3.7□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 APL6YGR261C 2430 nt3.69□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 YMR085WYMR085W 1299 nt3.69□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RDL1YOR285W 420 nt3.69□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ABF1YKL112W 2196 nt3.69□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 SAC1YKL212W 1872 nt3.69□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 GAL4YPL248C 2646 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ADK2YER170W 678 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RPL8AYHL033C 771 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 HEK2YBL032W 1146 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 GDT1YBR187W 843 nt3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.1 ms