Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	TAF11	YML015C	1041 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RRN11	YML043C	1524 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	WTM1	YOR230W	1314 nt		4.46	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RTT103	YDR289C	1230 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	MDM12	YOL009C	816 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RMI1	YPL024W	726 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	TOM5	YPR133W-A	153 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	OM14	YBR230C	405 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.45	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YND1	YER005W	1893 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YDL172C	YDL172C	480 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	HO	YDL227C	1761 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.44	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	VID30	YGL227W	2877 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	IFM1	YOL023W	2031 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	MLC1	YGL106W	450 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RFU1	YLR073C	603 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	ATP14	YLR295C	375 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	ORM2	YLR350W	651 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	DCS2	YOR173W	1062 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	SER1	YOR184W	1188 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	SRV2	YNL138W	1581 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	COT1	YOR316C	1320 nt		4.43	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	VID28	YIL017C	2766 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	CDC15	YAR019C	2925 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	PER1	YCR044C	1074 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	KNH1	YDL049C	807 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	BUD28	YLR062C	378 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YLR122C	YLR122C	378 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	ATR1	YML116W	1629 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	TEA1	YOR337W	2280 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	OAF1	YAL051W	3144 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YMR082C	YMR082C	357 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	OCA1	YNL099C	717 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RFA2	YNL312W	822 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	RPN5	YDL147W	1338 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	CLB4	YLR210W	1383 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	THI7	YLR237W	1797 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VIK1	Q12045	YIL028W	YIL028W	399 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YKL169C	YKL169C	384 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YMR085W	YMR085W	1299 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	RPC19	YNL113W	429 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	NCE102	YPR149W	522 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YCR023C	YCR023C	1836 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SER33	YIL074C	1410 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	AIM10	YER087W	1731 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	CKB2	YOR039W	777 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	APC4	YDR118W	1959 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	LAS21	YJL062W	2493 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YJR015W	YJR015W	1533 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	DCD1	YHR144C	939 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	PRE7	YBL041W	726 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YCL041C	YCL041C	495 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	CBP1	YJL209W	1965 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SRB5	YGR104C	924 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YGR291C	YGR291C	222 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YNG2	YHR090C	849 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	PML1	YLR016C	615 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	RSA3	YLR221C	663 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	CUZ1	YNL155W	825 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	ECM32	YER176W	3366 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YML020W	YML020W	1995 nt		4.36	□□□□□ -1.71

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