Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C2orf54Q08AI8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C2orf54Q08AI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms