Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LOXL1Q08397 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL1Q08397 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms