Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GOLGA3Q08378 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GOLGA3Q08378 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GOLGA3Q08378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GOLGA3Q08378 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GOLGA3Q08378 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3Q08378 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GOLGA3Q08378 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms