Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 CUE4YML101C 354 nt5.9□□□□□ -1.46
AVO1Q08236 RRG9YNL213C 645 nt5.9□□□□□ -1.46
AVO1Q08236 BUD17YNR027W 954 nt5.9□□□□□ -1.46
AVO1Q08236 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.9□□□□□ -1.46
AVO1Q08236 YNL011CYNL011C 1335 nt5.9□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 NSA1YGL111W 1392 nt5.9□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 DFG5YMR238W 1377 nt5.9□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SKS1YPL026C 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YCR015CYCR015C 954 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 IMG1YCR046C 510 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SDT1YGL224C 843 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 PDE1YGL248W 1110 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RPL24BYGR148C 468 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SOL3YHR163W 750 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 PPX1YHR201C 1194 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RFC2YJR068W 1062 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 OPI8YKR035C 642 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 OGG1YML060W 1131 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 NPT1YOR209C 1290 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 PLP2YOR281C 861 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TYE7YOR344C 876 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YPL257WYPL257W 582 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 UIP5YKR044W 1332 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 GPA2YER020W 1350 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 FHL1YPR104C 2811 nt5.89□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 PRY3YJL078C 2646 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CPR4YCR069W 957 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YDL016CYDL016C 303 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 FAL1YDR021W 1200 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MRPL7YDR237W 879 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RNA15YGL044C 891 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SEH1YGL100W 1050 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YGL185CYGL185C 1140 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YGL199CYGL199C 471 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 BUD32YGR262C 786 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SDS3YIL084C 984 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 OM45YIL136W 1182 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SPO7YAL009W 780 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YJL218WYJL218W 591 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 BAT2YJR148W 1131 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CCE1YKL011C 1062 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TAL1YLR354C 1008 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 GPI12YMR281W 915 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YBL096CYBL096C 309 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CUP9YPL177C 921 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RXT2YBR095C 1293 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YBR287WYBR287W 1284 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YNR066CYNR066C 1311 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 KEL1YHR158C 3495 nt5.88□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YNL095CYNL095C 1929 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 AIM20YIL158W 615 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 LYS1YIR034C 1122 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YKL107WYKL107W 930 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 GTO3YMR251W 1101 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RUF23RUF23 254 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 USV1YPL230W 1176 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 IMA5YJL216C 1746 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 GYP1YOR070C 1914 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 PRM2YIL037C 1971 nt5.87□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MGA1YGR249W 1371 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SRB7YDR308C 423 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 VMA3YEL027W 483 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CKA1YIL035C 1119 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 LCB3YJL134W 1230 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 VPS25YJR102C 609 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 FBA1YKL060C 1080 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MBR1YKL093W 1020 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MHT1YLL062C 975 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 NYV1YLR093C 762 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YML6YML025C 861 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TEM1YML064C 738 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YNL120CYNL120C 486 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 FAA4YMR246W 2085 nt5.86□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CNA1YLR433C 1662 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 VMA13YPR036W 1437 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 ERG8YMR220W 1356 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 GPD2YOL059W 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 KIN28YDL108W 921 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 ATC1YDR184C 885 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RTA1YGR213C 954 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CAB2YIL083C 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YNR062CYNR062C 984 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 HNT3YOR258W 654 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 SUR1YPL057C 1149 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 HUT1YPL244C 1020 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TAE1YBR261C 699 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RRP7YCL031C 894 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 ARN2YHL047C 1863 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 VPS70YJR126C 2436 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TRM1YDR120C 1713 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CCT8YJL008C 1707 nt5.85□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 ERT1YBR239C 1590 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 MKK2YPL140C 1521 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 TUP1YCR084C 2142 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 AIR2YDL175C 1035 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 YGR026WYGR026W 837 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 CMS1YLR003C 876 nt5.84□□□□□ -1.47
AVO1Q08236 RIF2YLR453C 1188 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89 ms