Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC3A1Q07837 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC3A1Q07837 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms