Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP4Q07065 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP4Q07065 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms