Protein–RNA interactions for Protein: Q06505

SPN1, Transcription factor SPN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPN1Q06505 DAL81YIR023W 2913 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 ATH1YPR026W 3636 nt5.4□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 LSM6YDR378C 261 nt5.4□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YFR035CYFR035C 345 nt5.4□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.4□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 LDB17YDL146W 1476 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 UBP9YER098W 2265 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PHO90YJL198W 2646 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YLF2YHL014C 1218 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ATP12YJL180C 978 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ARC19YKL013C 516 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 GAT3YLR013W 426 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SLZ1YNL196C 897 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 CLB5YPR120C 1308 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 HXT7YDR342C 1713 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 HXT6YDR343C 1713 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 DNF2YDR093W 4839 nt5.39□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ATG32YIL146C 1590 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PRM7YDL039C 2097 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SUP35YDR172W 2058 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 NOC4YPR144C 1659 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 MKS1YNL076W 1755 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 MCM21YDR318W 1107 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YHR022CYHR022C 771 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YKL023WYKL023W 834 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 AIF1YNR074C 1137 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YOL050CYOL050C 321 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 GSP2YOR185C 663 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YPL168WYPL168W 1293 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YDL109CYDL109C 1944 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 APC4YDR118W 1959 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SEC39YLR440C 2130 nt5.38□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YDL241WYDL241W 372 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 HSP31YDR533C 714 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 GRE3YHR104W 984 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ATG14YBR128C 1035 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 CDC28YBR160W 897 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 UBS1YBR165W 834 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SIF2YBR103W 1608 nt5.37□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YMR196WYMR196W 3267 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YER187WYER187W 426 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 NMA1YLR328W 1206 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 VAM3YOR106W 852 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YOR289WYOR289W 756 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 MAK3YPR051W 531 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YPR109WYPR109W 885 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PEX34YCL056C 435 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SEO1YAL067C 1782 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ESF1YDR365C 1887 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 NFI1YOR156C 2181 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 CDC4YFL009W 2340 nt5.36□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 FRS1YLR060W 1788 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 RVB1YDR190C 1392 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YDL157CYDL157C 357 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 TRM8YDL201W 861 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 CNL1YDR357C 369 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PAD1YDR538W 729 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SUT1YGL162W 900 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PCT1YGR202C 1275 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YBL029WYBL029W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SAP30YMR263W 606 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PFA4YOL003C 1137 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SRB6YBR253W 366 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 PXA1YPL147W 2613 nt5.35□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ARG4YHR018C 1392 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 TUB3YML124C 1338 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 LHP1YDL051W 828 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 INO2YDR123C 915 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YHR214WYHR214W 612 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 HPM1YIL110W 1134 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 YAR066WYAR066W 612 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 RPP0YLR340W 939 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 SYP1YCR030C 2613 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 ADE6YGR061C 4077 nt5.34□□□□□ -1.55
SPN1Q06505 STE20YHL007C 2820 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 ARO9YHR137W 1542 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 RAD57YDR004W 1383 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YEL028WYEL028W 462 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YER084WYER084W 387 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 AUA1YFL010W-A 285 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 SPO74YGL170C 1242 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 RPS0BYLR048W 759 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 DIA1YMR316W 1011 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 NCE103YNL036W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 ISA2YPR067W 558 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YTA6YPL074W 2265 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 MAG2YLR427W 2013 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 SEC9YGR009C 1956 nt5.33□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 MPH2YDL247W 1830 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 PSE1YMR308C 3270 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 TYW3YGL050W 822 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YLR402WYLR402W 192 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 MAP2YBL091C 1266 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 YOR342CYOR342C 960 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 snR17bsnR17b 332 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 UMP1YBR173C 447 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 SKG3YLR187W 3081 nt5.32□□□□□ -1.56
SPN1Q06505 RTC5YOR118W 1704 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.5 ms