Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTK2Q05397 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTK2Q05397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms