Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1Q04771 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms