Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX2Q04743 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms