Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFF2Q03403 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms